-
Thông tin E-mail
yilaibo@shyilaibo.com
-
Điện thoại
15221734409
-
Địa chỉ
B650, Khu B, 180 Đường Giang Nam, Quận Baoshan, Thượng Hải
Công ty TNHH Công nghệ sinh học ELEBO (Thượng Hải)
yilaibo@shyilaibo.com
15221734409
B650, Khu B, 180 Đường Giang Nam, Quận Baoshan, Thượng Hải
Tính linh hoạt về vị trí: Có thể được đặt ở thượng nguồn/hạ nguồn/intron của gen, lên đến mức Mb từ gen mục tiêu (ví dụ: bộ tăng cường SV40 kích hoạt từ xa gen beta globin).
Hướng không phụ thuộc: hướng chính phản đều có thể phát huy chức năng.
Hiệu quả cao: Tăng hiệu quả phiên mã gen mục tiêu lên hơn 100 lần (ví dụ: tăng cường điển hình dài khoảng 200 bp).
Loại tế bào cụ thể: Kích hoạt các gen mục tiêu khác nhau trong các tế bào/mô khác nhau (chẳng hạn như tăng cường đặc hiệu não điều chỉnh sự phát triển tế bào thần kinh).
Thuật ngữ phân tích:
gen tăng qGene Enhancement (Gene Enhancement): đề cập rộng đến cơ chế tăng hiệu quả biểu hiện gen, thường đề cập cụ thể đến tác dụng tăng cường.
Sự khuếch đại gen (Gene Amplification): Sự sao chép của một phần cụ thể của nhiễm sắc thể dẫn đến sự gia tăng số lượng bản sao của gen, khác với bản chất của điều hòa tăng cường.
| Mô hình | Cơ chế hoạt động | Bằng chứng thực nghiệm |
|---|---|---|
| Vòng nhuộm | Các chất tăng cường và các chất khởi động tạo thành vòng không gian thông qua CTCF/protein dính, gần nhau về mặt vật lý (Looping) | Công nghệ Hi-C chụp cấu trúc 3D của chất nhuộm |
| Trượt khuếch tán | Các yếu tố phiên mã liên kết các chất tăng cường trượt dọc theo DNA đến vùng con khởi động | Xác minh hình ảnh phân tử đơn |
| Kích hoạt Relay | Nhiều bộ tăng cường truyền tín hiệu kích hoạt trong chuỗi | Nghiên cứu điều hòa gen phát triển ruồi giấm |
Tuyển dụng nhân tố phiên mã:
Tăng cường bao gồmHệ số phiên mã liên kết cơ sở(ví dụ: cụm thứ tự cơ bản ZNF410), tuyển dụng TF cụ thể (ví dụ: GATA1).
TF tuyển dụng bằng cách kích hoạt một tên miền như VP64Phức hợp trung gian (mediator), trung gian lắp ráp RNA polymerase II.
Sửa đổi biểu sinh:
Tăng cường vùng làm giàuH3K27ac và H3K4me1Dấu kích hoạt bằng nhau, nhiễm sắc tố mở (ATAC-seq có thể phát hiện).
Các enzyme biến đổi histone như p300 xúc tác quá trình acetyl hóa và giải nén chromatin.
Siêu tăng cường (Super Enhancer):
Nhiều bộ tăng cường trong cụm chặt chẽ (>3 kb), làm giàu TF mật độ cao và trung gian, ổ đĩa mạnh mẽGen nhận dạng tế bào(ví dụ như gen đa năng tế bào gốc).
Ví dụ về quy định động:
Căng thẳng phốt pho thấp → Yếu tố phiên mã PHR liên kết với tăng cường lúa → Kích hoạt gen vận chuyển phốt pho → Điều chỉnh cấu trúc rễ [[Dữ liệu không được trích dẫn trực tiếp, dựa trên suy luận logic kích hoạt gen]].
| Phân cấp | Thành phần&Chức năng | Ý nghĩa sinh học |
|---|---|---|
| Tăng cường cơ bản | Đơn vị tăng cường duy nhất với một lượng nhỏ các vị trí gắn TF | Tinh chỉnh biểu hiện gen |
| Tăng cường trung tâm | Tích hợp nhiều tín hiệu tăng cường lõi (Hub Enhancer) để điều chỉnh biểu hiện cụm gen | Các thủ tục phát triển phối hợp (ví dụ: sự khác biệt hạch) |
| Siêu tăng cường | Cụm tăng cường nhịp lớn (>10 kb), tuyển dụng nồng độ TF cực cao với trung gian | Duy trì nhận dạng tế bào (ví dụ như đặc tính tế bào B) |
Dự phòngNhiều chất tăng cường làm việc cùng nhau để điều chỉnh cùng một gen (ví dụ, gen Shh của chuột được điều chỉnh bởi 9 chất tăng cường).
Hợp tácCác chuỗi cơ sở tương đồng (như cụm ZNF410) tăng hiệu quả kích hoạt thông qua tác dụng hiệp đồng (cơ chế tăng cường CHD4).
Chống ồnMạng lưới có thể duy trì sự ổn định biểu hiện gen khi thiếu một phần chất tăng cường.
| kỹ thuật | Nguyên tắc và lợi thế | Cảnh áp dụng |
|---|---|---|
| STARR-seq | Chèn một đoạn DNA ứng cử viên vào hạ lưu của gen báo cáo, trực tiếp định lượng hoạt động tăng cường | Bản đồ tăng cường bộ gen đầy đủ ruồi giấm |
| cATAC-seq | Kiểm tra mức độ tế bào đơn để xác định sự mở nhiễm sắc tố, xác định sự tăng cường đặc hiệu của loại tế bào | Chương trình Human Cell Atlas |
| Cắt & Tag | Sửa đổi histone định vị độ phân giải cao với vị trí gắn TF | Phân tích đánh dấu biểu kiến Super Booster |
Kích hoạt/triệt tiêu CRISPR:
dCas9-VP64 nhắm mục tiêu tăng cường kích hoạt và dCas9-KRAB ức chế chức năng của nó.
Tăng cường xóa/đột biến:
CRISPR loại bỏ trình tự lõi tăng cường và quan sát những thay đổi biểu hiện gen (như mô hình phôi chuột).
Tài nguyên cơ sở dữ liệu:
VISTA Enhancer Browser: Cơ sở dữ liệu tăng cường phát triển đã được xác minh.
SEdb: Nền tảng chú thích Super Booster.
| Các loại bệnh | Cơ chế tăng cường bất thường | Mục tiêu gen | Hậu quả |
|---|---|---|---|
| Ung thư | Tái cấu trúc siêu tăng cường gần gen ung thư (như MYC) | Các gen proliferative | Tế bào phát triển ngoài tầm kiểm soát |
| Bệnh tự miễn dịch | Miễn dịchgen tăng qTrẻ em mở quá mức (như IL6) | Yếu tố viêm | Tổn thương mô |
| Rối loạn phát triển | Đột biến tăng cường phát triển thần kinh (tăng cường FOXP2) | Gen di chuyển tế bào thần kinh | Rối loạn chức năng ngôn ngữ |
Liệu pháp ức chế tăng cường:
Chất ức chế BET (JQ1) ngăn chặn protein gắn superenhancer để điều trị bệnh bạch cầu.
Tăng cường biên tập:
CRISPR-dCas9 nhắm mục tiêu các chất tăng cường gây bệnh methyl hóa (như các chất tăng cường liên quan đến khối u).
Thiết kế tăng cường tổng hợp:
Các chất tăng cường mô đặc hiệu được xây dựng nhân tạo thúc đẩy biểu hiện gen điều trị (như liệu pháp tế bào CAR-T).